Ich kann keine klare Erklärung dafür finden, was das mRNA-Expressionsniveau ist und wie es gemessen wird. Ich würde mich freuen, wenn jemand es erklärt oder einen Hinweis gibt.
Das RNA-Expressionsniveau ist eine Schätzung der Menge oder des Anteils der RNA eines bestimmten Gens, die in einer Zellprobe (z. B. einer Gewebeprobe) oder sogar einer einzelnen Zelle gefunden wird.
Die Expression wird verwendet, weil die RNA-Sequenz gemäß den Signalen innerhalb der Zellen von DNA in RNA übersetzt wird.
Es gibt verschiedene Möglichkeiten, dies zu schätzen. Sie beinhalten häufig eine sequenzspezifische Sonde – normalerweise eine kurze DNA-Länge – die spezifisch an die fragliche RNA bindet. Die Exklusivität der Sondensequenz, die normalerweise 20–45 Basen lang ist, für die betreffende RNA kann variieren, und daher ist dies manchmal eine kleine Kunst.
Beispiele sind qPCR (quantitative PCR), Expressions-Microarrays . Beide Technologien haben viele Geschmacksrichtungen und Varianten.
Eine weitere Kategorie der Expressionsschätzung umfasst RNASeq – das alle RNA-Polymere in einer Probe sequenziert und alle Sequenzen gleichzeitig schätzt. Das Ergebnis ähnelt einem Mikroarray, aber RNASeq erfordert nicht unbedingt die Verwendung spezifischer Sonden für eine RNA, um sie zu messen, obwohl dies möglich ist.
Diese Schätzungen sind in der Regel relativ – außer vielleicht bei sorgfältiger qPCR. Die Zahlen werden normalerweise nicht als "X Kopien der RNA" in der Probe interpretiert.
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