Welche Informationen vermitteln Microarray-Bilder?

OK, ich habe gelesen, dass eine Zelle 4 Arten von digitalen (genauer gesagt diskreten) Daten erzeugt, nämlich DNA, RNA, Protein (Sequenzen, die als Zeichenfolgensequenzen von Nukleotiden / Aminosäuren codiert werden können) und Mikroarray-Bilder. Ich bin kein Biologe, aber mein Interesse gilt der Statistik und Informationstheorie dieser Daten. Ich würde gerne wissen, welche Informationen das DNA-Mikroarray-Bild vermittelt? Welche Informationen erhalten wir beispielsweise nach der Verarbeitung mit Hilfe einer geeigneten Software?

Beispielbild eines Mikroarrays:

Geben Sie hier die Bildbeschreibung ein

Im Allgemeinen zeigt die Farbe einfach an, wie viel einer bestimmten RNA oder DNA in Ihrer Probe enthalten ist. Was Sie dabei herausbekommen, hängt stark von dem genauen Experiment ab, das Sie durchführen.
Wo erhalte ich weitere Informationen? Welche Beziehung besteht zwischen dem Mikroarray-Bild und der Genexpression?
en.m.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray Im Zusammenhang mit einem Experiment auf Expressionsebene repräsentiert jeder Punkt eine einzigartige Oligonukleotidsonde. Die relative Farbintensität jedes Flecks zeigt Ihnen die relative Menge an RNA in der Zelle, die mit dieser Sonde hybridisiert.
Die Farbe ist auf ein fluoreszierendes Tag (Cy3/Cy5) zurückzuführen, das an der DNA angebracht ist, die Sie mit dem Array hybridisieren.

Antworten (1)

Jeder Spot überlappt mit einer Oligonukleotid- Sonde , die dazu bestimmt ist, eine spezifische Nukleinsäuresequenz zu identifizieren. Genexpressionsarrays haben Sonden, die komplementär zu Sequenzen sind, die von den Exons stammen; daher werden sie mit diesen Sequenzen hybridisieren.

Vor der Hybridisierung wird die cDNA (in diesem Fall) mit einem fluoreszierenden Molekül wie Cy3 oder Cy5 markiert (zwei Farbstoffe können verwendet werden, um behandelt und kontrolliert zu unterscheiden). Beachten Sie, dass jeder Punkt viele Sondenmoleküle haben wird. Die Fluoreszenzintensität ist proportional zur Anzahl der hybridisierten DNA-Stränge, die wiederum proportional zu ihrer Expression in der Probe ist.

Zur Microarray-Datenanalyse sind umfangreiche Texte verfügbar, die Sie ganz einfach finden können.

Welche Informationen vermitteln Microarray-Bilder?
AntwortenHierDatenschutz-Bestimmungen1y, 0v