PICs sind eine beliebte phylogenetische Vergleichsmethode, und ich habe mich gefragt, in welchen Einheiten die tatsächlichen Kontraste liegen. Ich möchte sagen, dass sie einheitenlos sind, aber ich bin mir nicht ganz sicher.
Soweit ich weiß, lautet die Antwort; es kommt darauf an . Wie Sie im Kommentar zu Remi.b hervorheben, werden Kontraste durch Zweiglängen (von denen angenommen wird, dass sie proportional zur "Evolutionszeit" sind) standardisiert, bevor sie analysiert werden (um standardisierte unabhängige Kontraste zu erhalten ). Verzweigungslängen können jedoch aus verschiedenen Quellen stammen (Divergenzzeiten, genetische Ähnlichkeit usw.), auf verschiedenen Evolutionsmodellen beruhen und auch transformiert sein (log usw.). Daher kann man im Allgemeinen nicht sagen, was die Einheiten standardisierter unabhängiger Kontraste sind. Sie wären jedoch wahrscheinlich nicht dimensionslos, da Astlängen selten (wenn überhaupt?) in denselben Einheiten wie die Rohkontraste ausgedrückt werden. Einheiten wie log(kg)/Jahroder kg/log(year) sind wahrscheinlicher. Letztendlich geht es beim Standardisieren im Normalfall darum, sicherzustellen, dass alle Kontraste in der Analyse das gleiche Gewicht erhalten, und das Erstellen geeigneter Astlängen kann ein Trial-and-Error-Prozess sein, bei dem Sie beispielsweise das Verhältnis zwischen Standardisierung untersuchen Kontraste und die Standardabweichung von Kontrasten, um zu sehen, ob sie ausreichend standardisiert wurden.
Ich denke, man könnte den Vorgang so beschreiben:
Hier sind ein paar relevante Zitate von Garland et al., 1992 :
...unabhängige Kontraste müssen ausreichend normiert werden, damit sie in späteren Korrelations- oder Regressionsanalysen gleichgewichtet werden.
Auch
Zweitens sollte die statistische Angemessenheit vorgeschlagener Astlängen als empirisches Problem betrachtet werden (vgl. Grafen, 1989, 1992; Harvey und Pagel, 1991; Pagel und Harvey, 1992). Drittens können unterschiedliche Transformationen – und tatsächlich völlig unterschiedliche Zweiglängen, basierend auf unterschiedlichen Informationen – für unterschiedliche Zeichen verwendet werden. Die Verwendung unterschiedlicher Verzweigungslängen für unterschiedliche Zeichen wäre analog zur Verwendung unterschiedlicher Transformationen für die beiden Variablen in einer gewöhnlichen Korrelation oder Regression.
endlich
Standardisierte unabhängige Kontraste zeigen im Wesentlichen minimale durchschnittliche "Raten" (oder, in Booksteins [1988] Terminologie, "reduzierte Geschwindigkeiten") von Charakteränderungen an, die entlang zweier Zweige auftreten, die von einem gemeinsamen Vorfahren abstammen (Garland, 1992). Da sie standardisiert sind, geben sie keine absoluten Änderungsbeträge an. Beispielsweise kann ein großer Kontrast (absoluter Unterschied) zwischen zwei Arten an den Spitzen einer Phylogenie einen kleinen standardisierten Kontrast ergeben, wenn die Zweiglängen dieses Kontrasts lang sind.
Oreotrephes
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