Unser Lehrer hat uns ein Projekt zugeteilt, das mit einer äußerst offenen Aufforderung zu tun hat und innerhalb eines Monats abgeschlossen sein sollte. Ich hatte vor, etwas zu tun, das mit Berechnung und Evolution in Bezug auf Biologie zu tun hat, obwohl ich nicht wirklich sicher bin, wo ich anfangen soll. Ich sage einfach, weil ich kein professioneller Programmierer bin, sondern mich sehr für das Gebiet interessiere und ich hoffe, dies als Gelegenheit nutzen zu können, um meine Fähigkeiten zu erweitern. Irgendwelche Ideen auf einem Projekt oder wo man anfängt, würden sehr geschätzt.
Sie können BLAST- oder NCBI-Ressourcen verwenden, um beispielsweise eine Analyse von etwas wie der Duplikation eines Gens im HIV-Virus durchzuführen. Wenn Sie nach einem Ausgangspunkt suchen, würde ich empfehlen, sich einfach mit den Ressourcen der NCBI-Datenbank vertraut zu machen.
Zusätzlich zu den Vorschlägen von Ham Radio ist das Auschecken von Galaxy möglicherweise keine schlechte Idee, um Berechnungen / Analysen durchzuführen, die sonst auf der Befehlszeile durchgeführt werden müssten. Sehen Sie sich insbesondere Tools für Sequenzalignment (BWA und Bowtie), Genomassemblierung (Velvet, Spades, IDBA-UD) und Variantenanalyse (Freebayes, Mpileup, GATK) an. Viel Glück!
MattDMo
If your motivation for asking the question is “I would like to participate in a discussion about ______”, then you should not be asking here.werden jedoch einfache Google-Suchen viele Treffer für Projektideen sowie Websites hervorbringen, auf denen diese Art von Diskussion zum Thema gehört, wie z. B. Reddit oder Quora . Viel Glück!James