Wie kann man entscheiden, ob Gene in einem ungeordneten Kartierungsproblem verknüpft sind?

Wenn die aus einer Kreuzung resultierenden Tetraden die gleiche Anzahl von elterlichen Ditypen aufweisen wie es nicht-elterliche Ditypen gibt, werden die betrachteten Gene nach meinem Verständnis als nicht verknüpft bezeichnet.

Sagen wir zum Beispiel, ich kreuze zwei enthaltende Gameten A B + Und A + B , und erhalten 170 Tetraden, die einen elterlichen Dityp aufweisen (alle Nachkommen sind A B + oder A + B ), 165 mit nicht elterlichem Dityp (Nachkommen sind A + B + oder A B ) und 30 ausstellende Tetratypen (Nachkommen einer von A + B + , A + B , A B + oder A B ).

Ich bin mir nicht sicher, ob ich diese Gene als verknüpft oder nicht verknüpft einstufen soll. Ich möchte ja sagen, sie sind tatsächlich miteinander verbunden, aber 170 und 165 scheinen nahe genug an Zahlen zu liegen, um darauf hinzuweisen, dass sie möglicherweise nicht verbunden sind.

Ich würde denken, dass das Verhältnis von elterlichem zu nicht elterlichem Dityp nahe genug bei 1 liegen muss, aber wie legen wir einen Schwellenwert dafür fest?

Antworten (1)

Ich würde einen Chi-Quadrat-Test verwenden. Sie berechnen, was Sie zu sehen erwarten, wenn Ihre Hypothese wahr ist, und Sie nehmen, was Sie sehen, und das Chi-Quadrat-Ergebnis sagt Ihnen, wie wahrscheinlich es ist, dass Ihre Ergebnisse so weit von den Erwartungen abweichen, dass Ihre Hypothese falsch ist.

Okay das ergibt für mich Sinn. Gibt es eine Möglichkeit, die erwartete Verteilung für die Tetraden-Genotypen zu ermitteln?