Wie viele verschiedene Arten von Polypeptiden, die jeweils aus 12 Aminosäuren bestehen, könnten unter Verwendung der 20 gemeinsamen Aminosäuren synthetisiert werden?
Die Antwort des Buches lautet .
Ich bin jedoch anderer Meinung. Dieses Ergebnis unterscheidet die folgenden zwei Polypeptide, obwohl sie genau das gleiche Polypeptid sind:
(Met)x11-Glu
und
Glu-(Met)x11
Habe ich recht? Wie würde ich diese Frage sonst beantworten? Mein Hintergrund in Wahrscheinlichkeiten ist sehr schwach.
Nach dem zu urteilen, was Sie gesagt haben, gehe ich davon aus, dass Kombinatorik kein Problem für Sie ist.
Ich glaube, Ihr Problem ist, dass Sie denken, dass Glu-(Met)x11 gleich (Met)x11-Glu ist, nur umgedreht. Das ist jedoch keine richtige Denkweise. Aminosäuren sind keine symmetrischen Moleküle, daher erzeugt eine umgekehrte lineare Kombination keine umgekehrte (sei es chiral oder nicht) Form einer ähnlichen Aminosäure. Ich vermute, dass Sie Aminosäurenamen hintereinander schreiben, wenn Sie Peptide darstellen. Dieses Verfahren hat ein kleines Problem, dass es keine Direktionalität von Molekülen beinhaltet. Das Zeichnen des ganzen Moleküls mag eine Lösung sein, aber das ist zu viel Arbeit.
Meine Lösung besteht darin, eine kleine Markierung (vielleicht einen Pfeil oder eine > Markierung) hinzuzufügen, um eine bestimmte Seite des Aminosäuremoleküls (Amingruppe oder Carboxylgruppe) darzustellen, sodass die Sequenz gespiegelt wird (so dass die Markierung an der "andere" Seite jeder Aminosäure) würde tatsächlich ein Peptidmolekül erzeugen, das sich von der Umkehrung der Sequenz unterscheidet (so dass sich die Markierung immer noch auf der "normalen" Seite jeder Aminosäure befindet). Wenn Sie der Meinung sind, dass das nicht gut aussieht, können Sie um jede Aminosäure einen Rahmen ziehen, bei dem eine Seite der Aminosäure eine Delle und die andere Seite eine Beule hat (um die Amin- und Carboxylgruppen darzustellen), sodass nur a eine gestoßene Seite kann sich mit einer verbeulten Seite verbinden. Das Spiegeln der Sequenz würde auch die Positionen der Unebenheiten und Dellen umkehren,
Stellen Sie sich die Auswahl an Aminosäuren als 12 Plätze vor. Auf dem ersten Platz haben wir 20 Möglichkeiten. Auf dem nächsten Platz haben wir 20 Möglichkeiten, und das geht weiter. Daher haben wir das
Bis zu diesem Punkt haben wir die Abfolge von Aminosäuren betrachtet, aus denen ein Protein besteht. Dies ist die erste von mehreren Ebenen der Proteinstruktur, die in Abb. 4.4 dargestellt sind. Die Abfolge der Aminosäuren in einem Protein ist seine Primärstruktur. Die Abfolge der Aminosäuren bestimmt letztlich, wie sich ein Protein faltet [1] .
Die einzelnen Aminosäuren sind nicht symmetrisch. Somit sind Ihre beiden Beispielpeptide chemisch nicht äquivalent, und die Abbildung stimmt.
yolo123