Zeigen die Phagen-Repressoren CI und Mnt Crosstalk?

Ich interessiere mich für die Verwendung der CI- und Mnt-Proteine ​​sowie ihrer jeweiligen Promotoren (pR und Pmnt) innerhalb desselben synthetischen Systems, mache mir jedoch Sorgen wegen ihrer Ähnlichkeit und möglichen Wechselwirkung. Eine schnelle Suche in der Literatur ergab keine Ergebnisse, und ein Multalin zeigte eine gewisse signifikante Sequenzhomologie (obwohl Mnt ein Homodimer bildet, während CI dies nicht tut).

CI und Mnt Multalin

pR und Pmnt Multalin

Sequenzen: CI und pR , Mnt-Repressor und Mnt-Promotor

Wurde jemals berichtet, dass der CI- oder Mnt-Repressor ein Übersprechen auf die pR- und Pmnt-Promotoren zeigt?

Antworten (1)

Es liegen noch keine Berichte dazu vor. Ich glaube nicht, dass sie Übersprechen zeigen würden, nur weil sie eine allgemeine Homologie zeigen. Sehen Sie sich einfach die Ausrichtung der DNA-Bindungsdomänen dieser Proteine ​​an, die ersten ~70 Reste vom N-Terminus entfernt. Darüber hinaus gehören ihre DBDs zu verschiedenen PFAM-Familien.

Ähnlich mit den Promotorsequenzen. Wie auf der iGEM-Website berichtet:

  • Mnt-Promoter:tagatctcctatagtgagtcgtattaattt

  • cI-Promotor:gtgttgactattttacctctggcggtgata

Sie sind ganz anders. Wenn iGEM über einen gemeldeten Standardteil wie eine bistabile Systemkomponente verfügt: Mnt/cI-Promotor ( BBa_K228003 ), wäre er außerdem ziemlich standardisiert gewesen. iGEM-Teile sind normalerweise zuverlässig.

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