Finden Sie die Länge der DNA-Sequenz? [geschlossen]

Gegeben N = 5 × 10 3 und Mutationsrate ist μ = 10 − 5 Finden Sie pro Stelle die Länge einer DNA-Sequenz, so dass die Wahrscheinlichkeit des Auftretens einer Mutation M größer oder gleich 0,95 ist.

Gibt es eine Methode oder eine Formel für diese Art der Berechnung?

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Hinweis: Versuchen Sie, die Wahrscheinlichkeit zu berechnen, dass eine Mutation an einer einzigen Stelle (in einer einzigen Generation) auftritt. Berechnen Sie dann dieselbe Wahrscheinlichkeit für 100 Standorte. Und von dort aus sollten Sie sehen, was los ist.
Ist N die Bevölkerungszahl? Wir verwenden normalerweise N für die Bevölkerungsgröße. Davon würde ich auch ausgehen μ ist die Mutationsrate pro Stelle (pro Basenpaar). Schließlich probability of mutationwürde ich davon ausgehen, dass gemeint ist probability of 1 or more mutations, genau wie die Formel if andeutet M bedeutet die Anzahl der Mutationen.
Ich habe gerade festgestellt, dass es zwei Möglichkeiten gibt, die Frage zu verstehen. mutationMeinst du damit mutant alleleoder meinst du mutational event(siehe hier )?
Ich meine mit einem Ereignis, ja
Sie brauchen also keine a priori über die Reihenfolge. Die Wahrscheinlichkeit, dass eine Mutation an einer bestimmten Stelle auf einem bestimmten Haploiden auftritt, ist 10 − 5 . Wie hoch ist diese Wahrscheinlichkeit für die Gesamtpopulation (vergessen Sie nicht, dass Individuen wahrscheinlich als diploid angenommen werden)? Sie können diese Wahrscheinlichkeit dann für 100 Standorte berechnen und verstehen das Muster. Macht das Sinn?
Ok, also für jede Seite: P ( M > 0 ) = 10 − 5 bedeutet das für N = 5000 , wir bekommen P ( M > 0 ) = 5000 ∗ 10 − 5 = 0,05 für eine Seite?
Ich bin mir wirklich nicht sicher, wie diese Methode es uns ermöglichen würde, die sicherzustellende Länge zu finden P ( M > 0 ) ≥ 0,95 . ich weiß, dass θ = 2 N μ , was meiner Meinung nach so verwendet werden kann θ = 0,1 pro Basis. Aber ich verstehe nicht, wie ich das in Bezug auf die eigentliche Frage beantworten soll
Ok gut! 0,1 ist richtig. (0,05 wäre richtig, wenn man Haploidie annimmt). Jetzt für 100 Seiten? Und dann einfach fragen, bei wie vielen Seiten ist die Wahrscheinlichkeit 0,95

Antworten (1)

Die Mutationsrate pro Haplotyp pro Standort ist μ = 10 − 5 . Unter der Annahme von Diploidie und einer Bevölkerungsgröße von N = 5000 , ist die bevölkerungsweite Mutationsrate pro Standort 10 − 5 ∗ 5000 ∗ 2 = 0,1 .

0,1 ist somit die Wahrscheinlichkeit, dass eine Mutation an einer bestimmten Stelle (in der gesamten Population) auftritt. Bei 10 Stellen beträgt die Wahrscheinlichkeit, dass an mindestens einer Stelle eine Mutation auftritt 1 − ( 1 − 0,1 ) 10 = 0,65 .

Die angestrebte Wahrscheinlichkeit beträgt 0,95. Schreiben wir also die Gleichung

1 − ( 1 − 0,1 ) X = 0,95

, Wo X ist die Anzahl der Seiten, nach denen wir suchen. Sie müssen nur auflösen X jetzt und auf die größere ganze Zahl aufrunden.

Ok, das bezieht sich also auf die Anzahl der Stellen, um also die Länge der Sequenz in Basenpaaren zu berechnen, würden wir mit multiplizieren 10 3 sagen? Ich versuche, mich über Basenpaare zu informieren, und das habe ich gesammelt, aber ich kann mich irren. (Ansonsten ist diese Antwort vollkommen in Ordnung, ich sehe nur in vielen Literaturstellen, dass die Längen normalerweise in bp angegeben werden?)
Eine Website ist ein bp. Die Zahl der X ist die Länge der Sequenz (in Basenpaaren), nach der Sie gesucht haben. Wenn Sie die Antwort in Kilo bp ausdrücken möchten, können Sie das Ergebnis durch dividieren 10 3 aber ich würde es nicht empfehlen. X , einmal gerundet, ist Ihre Antwort
OK! Ich vergleiche dies mit mitochondrialer DNA, die im Allgemeinen 16.500 bp lang ist, daher scheint das Lösen der obigen Gleichung von 29 sehr ungewöhnlich zu sein. (ref: ncbi.nlm.nih.gov/m/pubmed/26798311 )
Die Antwort hängt von der Frage ab. Sie versuchen normalerweise nicht, jeden Tag die Frage zu beantworten: "Was ist die Sequenzlänge, und die Wahrscheinlichkeit, von einer Mutation in einer bestimmten Generation getroffen zu werden, beträgt 0,95?". Ich denke nicht, dass Sie von sich selbst erwarten sollten, viel Intuition bei der Antwort zu haben, und daher ist nichts Ungewöhnliches zu finden. Ich verstehe nicht, warum die Länge der menschlichen mtDNA hier eine Rolle spielt.
Nur weil zum Beispiel die Mutationsrate (pro Stelle) von mtDNA auch allgemein ist μ = 10 − 5 also ich wollte mal vergleichen
Oh, ok. Sicher ... also ja, jede Generation passieren viele Mutationen auf mtDNA (noch mehr, wenn man 7 Milliarden Menschen berücksichtigt).
Finden Sie die Länge der DNA-Sequenz? [geschlossen]
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