Optimierung der Gelelektrophorese: Ampere, Volt und Pufferkonzentrationen

Ich bin Masterstudent in Biochemie und habe schon oft Gelelektrophorese verwendet. Was ich wissen möchte, ist, wie man den mA (mAmpere) im Vergleich zur Spannung und dem verwendeten Puffer einstellen sollte.

Normalerweise habe ich 1xTAE-Puffer (bei 90V laufen) oder 1x Natriumborat-Puffer (bei 110V laufen) verwendet. Ich weiß, wenn ich die Spannung nach oben stelle, erwärmt sich der Puffer schneller, die Proben bewegen sich schneller, aber das "Bild" des Gels wird unschärfer. Dies ist jedoch alles, was ich über das Anpassen des Parameters weiß.

Meine Fragen lassen sich also wie folgt zusammenfassen:

  1. Wie sollte ich die Ampere einstellen, gibt es einen Bereich, in dem ich im Vergleich zu dem Puffer oder der Probe, die ich verwende, liegen sollte?

  2. Wirkt sich das Ampere auf die Fahrgeschwindigkeit aus, wenn es nach oben oder unten eingestellt wird?

  3. Kann ich die Konzentration des Puffers anpassen, um die Probe bei einer höheren Spannung laufen zu lassen, welche Auswirkungen hat dies (um die Konzentration zu erhöhen oder zu verringern)?

  4. Gibt es eine Beziehung zwischen Ampere und Spannung, die ich manipulieren kann, in diesem Fall: wie und warum?

Auch diese Seite von Thermofisher gibt viele Tipps zur Optimierung: thermofisher.com/se/en/home/life-science/pcr/…

Antworten (1)

  1. Soweit ich weiß, können Sie entweder das Ampere oder die Spannung einstellen, da beide vom Widerstand des Puffers abhängig sind. Was bedeutet, dass ich Ihnen vorschlagen würde, die Spannung so zu lassen, wie sie ist.

  2. Da Ampere = Spannung / Widerstand und Spannung = Widerstand * Ampere und wie man sieht, muss die Spannung höher werden, wenn das Ampere erhöht wird, und das Ampere muss höher werden, wenn die Spannung erhöht wird (zumindest wenn ich es richtig verstehe ) sollte die Fahrgeschwindigkeit erhöht werden, je höher das Ampere eingestellt ist.

  3. Ich würde die Konzentration des Puffers weder verringern noch erhöhen. Vielleicht würde Ihnen die Verwendung einer anderen Art von Puffer helfen. Dies hängt jedoch von den verschiedenen Proben ab, die Sie ausführen. Vielleicht könnte Ihnen das helfen: Brody, JR, und Kern, SE (2004). Geschichte und Prinzipien leitfähiger Medien für die Standard-DNA-Elektrophorese. Analytische Biochemie 333, 1–13.

  4. Der Widerstand ist mehr oder weniger gegeben. Daher meines Wissens: Nein.