Proteine: Posttranslationale Modifikation

Ich bin Physiker und versuche, für ein kleines Projekt etwas Proteinchemie zu verstehen. Grundsätzlich verbinden sich Aminosäuren zu Proteinen, und nach der Bildung der Primärstruktur können einige chemische Modifikationen auftreten, wie z. B. Phosphorylierung oder Glykosylierung (posttranslationale Modifikation). Bei dem Enzym Carboanhydrase wird posttranslational ein Zinkion als Cofaktor hinzugefügt. (Die Aminosäuresequenz kann hier eingesehen werden (scrollen Sie nach unten zum Titel „Sequenz“).

  1. Wird die Anlagerung von Zink als eine Art posttranslationale Modifikation angesehen?

  2. Wird bei der Denaturierung von Carboanhydrase das Zinkion in das Medium freigesetzt?

  3. Wird die Aminosäuresequenz (Primärstruktur) nach der Denaturierung verändert? Wenn ja, werden nach der Denaturierung Aminosäuren entfernt, wenn ja, welche?

  4. Ich denke, Zink wird nach der Denaturierung entfernt. Ist die verbleibende Struktur die primäre Proteinstruktur?

Antworten (1)

1) Wird die Anlagerung von Zink als eine Art posttranslationale Modifikation angesehen?

Es wird nicht wirklich als posttranslationale Modifikation angesehen, da das Zinkatom nicht kovalent an das Protein gebunden ist. Die Bindung an Zink ist Adsorption.

2) Wenn Carboanhydrase denaturiert wird, wird das Zinkion in das Medium freigesetzt?

Ja, aber das hängt auch vom Ausmaß der Denaturierung ab. Metallionen können mit Chelatliganden wie EDTA entfernt werden, ohne das Protein tatsächlich zu denaturieren.

3) Wird die Aminosäuresequenz (Primärstruktur) nach der Denaturierung verändert? Wenn ja, werden nach der Denaturierung Aminosäuren entfernt, wenn ja, welche?

Die Denaturierung umfasst nicht die Spaltung kovalenter Bindungen. Es wird keine Änderung in der Aminosäuresequenz geben.

4) Ich denke, Zink wird nach der Denaturierung entfernt. Ist die verbleibende Struktur die primäre Proteinstruktur?

Ja; nur das Polypeptid.

Wie wird die Proteinsequenz nach der Denaturierung aussehen (die im Link in meiner Frage angegebene Sequenz)? Woher kenne ich den Buchstaben, der dem Zink entspricht (ist es M?)?
@aneps Es wird genauso aussehen. M ist Methionin