Das menschliche Genom hat viele nichtkodierende Regionen, die regulatorische Elemente, repetitive DNA und Introns umfassen. Angenommen, es gibt zwei benachbarte Gene auf einem Chromosom und ihre Positionen auf dem Chromosom sind, sagen wir,
Für das erste Gen: 11.785.723 bis 11.803.245 bp.
Für das zweite Gen: 11.806.096 bis 11.806.143 bp. Diese Werte beinhalten auch ihre regulatorischen Elemente, Promotor und Introns.
Welche Sequenz ist also zwischen den Basen 11.803.245 und 11.806.096 vorhanden? Sind es Satellitensequenzen? Ist diese nicht codierende, nicht regulatorische Region 11.803.245 bis 11.806.096 bp Heterochromatin?
Nein. Die intergenischen Regionen sind nicht notwendigerweise Heterochromatin. Chromatin-Konformationen haben normalerweise eine sehr große Reichweite und sind normalerweise nicht auf ein einzelnes Gen beschränkt. Die Ausbreitung des Chromatinzustands kann durch Isolatoren/Randelemente verhindert werden , die wiederum nicht Teil der transkribierten Region sind. Die intergenischen Regionen können auch distale regulatorische Elemente wie Enhancer und Silencer beherbergen; sie können auch Mikrosatelliten, Transposons usw. haben. Um zu wissen, was es alles in einer bestimmten Region gibt, können Sie sich die verschiedenen Tracks im UCSC-Genombrowser ansehen .
Kurz gesagt, es kann funktionelle und/oder nicht funktionelle DNA zwischen den transkribierten Regionen geben.
Wiederholungsregionen müssen nicht heterochromatinisiert sein und umgekehrt bestehen nicht alle heterochromatischen Regionen aus Wiederholungen.
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Karl