Ich bin ein Biologe, der nicht viel von Molekulargenetik und der Dynamik biochemischer Reaktionen versteht.
Frage
Meine Frage betrifft den Einfluss der Temperatur auf die Dynamik molekulargenetischer Prozesse. Normalerweise würde ich gerne wissen, wie (quantitativ gesehen, auf der Suche nach der zum Beispiel) werden die folgenden Parameter mit der Temperatur modifiziert.
Warum stelle ich diese Frage?
Um zu wissen, welche Art von Standardparameterwerten ich für Modellierungszwecke in der Evolutionsbiologie eingeben sollte. Obwohl unser Anwendungsbereich groß ist, haben wir beschlossen, Parameterwerte zu berücksichtigen, die in Hefe beobachtet werden.
Das klingt einfach, wenn man darüber nachdenkt, aber harte Beweise zu finden, ist nicht wirklich einfach. Da dies für einen Kommentar zu lang ist, muss ich es als Antwort einfügen. Nur ein paar Gedanken: Alle enzymatischen Reaktionen sind natürlich temperaturabhängig und haben meist ein Temperaturoptimum bei den jeweiligen Wohntemperaturen. Bei Hefe liegt diese bei etwa 27°C, bei Thermophilen deutlich höher. Für die Transkription spielen neben der höheren Aktivität eines Enzyms eine Reihe weiterer Faktoren wie die Zugänglichkeit des Chromatins und die Verfügbarkeit von Cofaktoren eine wichtige Rolle. Diese Abhandlung könnte für Sie interessant sein: „ Direkte Messung von Transkriptionsraten enthüllt mehrere Mechanismen zur Konfiguration der Arabidopsis-Umgebungstemperaturreaktion “.
DNA-Bindung sollte ein statistischer Prozess zwischen Assoziation und Dissoziation an einer gegebenen Bindungsstelle sein. Bei höheren Temperaturen sollte der Umsatz an der Bindungsstelle höher sein (weil mehr Energie verfügbar ist, um die Dissoziation zu fördern). T
Remi.b
Chris