Hintergrund
Zitat aus Gillespies Buch
Der Grad der Inzucht wird durch den Inzuchtkoeffizienten gemessen, , das ist die Wahrscheinlichkeit, dass zwei Allele in einem Individuum durch Abstammung identisch sind.
Die beiden möglichen Allele sind Und und ihre Frequenzen sind Und , bzw. Gillespie fährt fort und gibt die erwarteten Genotyphäufigkeiten an (Und ) Und
Frage
Können Sie mir bitte helfen zu verstehen, warum dies die geeigneten Genotypfrequenzen sind?
Beispiel was mir unklar ist
Nach der Definition von , ich hatte erwartet, dass die Häufigkeit von ` (Und ) wäre , das ist die Häufigkeit (oder Wahrscheinlichkeit), dass zwei Allele in einem Individuum nicht durch Abstammung identisch sind. Ich habe das Gefühl, dass die oben angegebene Definition falsch ist. Sollte es eher so etwas wie das Gewicht für die Probenahme wie Einzelpersonen sein? Das heißt, wenn es nur zwei mögliche Partner gäbe, einen und eines, das beides ist oder , dann die Wahrscheinlichkeit für a Individuum, um sich mit dem anderen zu paaren Ist .
Sie sind verwirrt, weil Sie nicht zwischen „identisch“ und „identisch durch Abstammung“ unterscheiden können. Einige Allelpaare wären auch ohne Inzucht identisch.
Wir modellieren die Inzucht, indem wir Allelpaare als IDB – immer homozygot – oder nicht IDB – verteilt nach Hardy Weinberg klassifizieren. Die Häufigkeit eines Allelpaares, das A 1 , A 2 (oder A 2 , A 1 ) ist, ist somit die Häufigkeit unter HWE (2pq) multipliziert mit der Wahrscheinlichkeit, dass sie NICHT IBD (1-F I ) sind. Und umgekehrt kann ein Paar homozygot und nicht IBD sein – bei der Frequenz p 2 (1 – F I ) oder weil sie IBD sind – bei der Frequenz p F I .
Remi.b
Dermot Harnett
Remi.b