Ich frage mich, ob ich das Trizol-Reagenz 30 Minuten lang auf 65 ° C erhitzen kann. Das Ziel ist es, den Protein-RNA-Komplex zu stören und gleichzeitig Nukleasen zu hemmen. (Ich kann RNasin nicht verwenden, weil es bei 65 ° C inaktiviert wird, und ich kann RVC nicht verwenden, da die Reaktion EDTA enthält). Mir ist klar, dass das Erhitzen von Trizol nicht sicher ist und seine Dämpfe gefährlich sind, aber ich kann es in der Abzugshaube durchführen.
Das Arbeiten mit heißen Phenollösungen wird aufgrund der damit verbundenen Gefahren selten durchgeführt. Phenol muss ohnehin im Abzug gehandhabt werden, bei höheren Temperaturen wird es noch flüchtiger. Wenn Sie dies also vorhaben, tun Sie dies mit besonderer Sorgfalt, um Verletzungen zu vermeiden.
Es gibt ein Papier, das diese Methode für Bakterien beschreibt, aber das sollte auch für andere Proben funktionieren: „ Evaluierung von Isolierungsmethoden und RNA-Integrität für die bakterielle RNA-Quantifizierung “. Es gibt jedoch eine andere Methode, die zur Extraktion von RNA aus bakteriell infiziertem Pflanzenmaterial entwickelt wurde und ebenfalls einen Versuch wert ist (wenn auch möglicherweise einer Anpassung bedarf), die ohne heißes Phenol auskommt: „Eine optimierte Methode zur Extraktion bakterieller mRNA aus mit Escherichia coli O157:H7" infizierten Pflanzenwurzeln .
MattDMo
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