Primer für menschliches Gewebe? [geschlossen]

Wenn ich menschliche Gewebeproben wie Haare, Blut, Fingernägel usw. auf ihre DNA untersuchen wollte, welche Primer würde ich für die Amplifikation der DNA bei der Extraktion (PCR) verwenden?

Bearbeiten: Um die STR im menschlichen Genom basierend auf dem CODIS-System des FBI zu betrachten http://en.wikipedia.org/wiki/Combined_DNA_Index_System

aus Wikipedia:

„CODIS identifiziert genetische Marker an 13 STR-Loci sowie Amelogenin (AMEL) zur Bestimmung des Geschlechts.

CSF1PO
D3S1358
D5S818
D7S820
D8S1179
D13S317
D16S539
D18S51
D21S11
FGA
THO1
TPOX
vWA

"

Ich habe etwas über CODIS gelesen, aber ich weiß nicht allzu viel darüber, wenn mir jemand einige hilfreiche Einzelheiten geben könnte.

Das menschliche Genom ist 3 Milliarden Buchstaben lang. Sie werden sich das alles nicht ansehen, oder? Man muss wissen, was man sehen will. Versuchen Sie nur, die Mikrosatelliten zu untersuchen, die beim DNA-Fingerabdruck verwendet werden?
@swbarnes2 Entschuldigung, ich habe nicht nachgedacht, ich möchte mir einen Mikrosatellitenbereich ansehen, eine Teilmenge, von der ich glaube, dass sie STR (Single Tandem Repeats) heißt, da sie früher schon früher zur Identifizierung verwendet wurden?
Zu sagen, dass Sie sich die STR ansehen möchten, ist immer noch ziemlich weit gefasst.
@Chris Ich denke, ich möchte die gleiche Art der Identifizierung durchführen, die das FBI mit seinem CODIS-System durchführt

Antworten (2)

Die Abschnitte „Referenzen“ und „Externe Links“ des Wikipedia-Artikels in Ihrer Frage enthalten viele relevante Informationen, die Ihnen den Einstieg erleichtern. Es gibt einen Link zum CODIS und NDIS (National DNA Index System) Fact Sheet des FBI, das viele relevante Informationen enthält, einschließlich Teilenummern für validierte Kits von mehreren Herstellern. DOI-Nummern für einige Zeitschriftenartikel sind auch im Wikipedia-Artikel angegeben, in denen Sie möglicherweise spezifische Primersequenzen oder Referenzen dafür finden können. Schließlich gibt es einen Link zur Hauptseite von CODIS auf FBI.gov, die eine Fülle nützlicher Informationen enthält, einschließlich des NDIS-Handbuchs für Betriebsverfahren.

Sie müssen nur suchen, um zu finden, was Sie suchen.

Die Extraktion genomischer DNA und PCR sind unterschiedliche Prozesse. Das Extrahieren genomischer DNA bedeutet, dass Sie alle DNA-Sequenzen aus dem menschlichen Genom erhalten. Mit extrahierter DNA können Sie eine bestimmte Region aus der gesamten genomischen Sequenz amplifizieren.

Ein Primer-Set wird normalerweise an die beiden Enden einer Sequenz gesetzt, die Sie amplifizieren möchten. In Ihrem Fall würde Ihnen der in der Abbildung "CODIS-Marker" des Wikis gelb markierte Bereich verstärkt.

Verschiedene Personen können Primer unterschiedlich setzen, selbst wenn sie dieselbe Region amplifizieren möchten; jedoch sind in diesem Fall Primersequenzen bereits bestimmt, um konsistente Ergebnisse zu erhalten. Wenn Sie wissen möchten, welche Sequenzen das FBI tatsächlich verwendet, müssen Sie (oder jemand oder ich) suchen, um sie zu finden.

Übrigens können einige Protokolle den Extraktionsprozess überspringen – mehrere Mikroliter Puffersuspension von Proben oder ähnliches nehmen. Es kann davon abhängen, ob das PCR-Enzym die hemmenden Wirkungen von rohen DNA-Lösungen überwinden kann, um Fragmente zu amplifizieren.
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